Des tests sur les eaux usées aux États-Unis détectent une variante fortement mutée du COVID-19.

Variant of highly mutated COVID-19 detected in US wastewater tests.

Les responsables de santé publique ont détecté la nouvelle variante BA.2.86 du COVID-19 dans les eaux usées aux États-Unis, suscitant des inquiétudes concernant la variante fortement mutée aux États-Unis.

Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont annoncé cette détection mercredi.

Cela a été découvert dans le cadre d’un échantillonnage régulier des eaux usées. Les responsables n’ont pas précisé l’origine des échantillons.

À l’échelle mondiale, neuf séquences de la nouvelle variante ont été signalées chez des personnes atteintes de COVID-19, selon CNN. Outre les deux aux États-Unis, les autres sont au Danemark, en Afrique du Sud, au Royaume-Uni et en Israël. La Suisse a détecté la variante à faible niveau dans les eaux usées.

« [Cela] est une preuve de transmission internationale », a déclaré le CDC mercredi.

Les deux séquences américaines provenaient de patients du Michigan et de Virginie. Le patient de Virginie venait de rentrer d’un voyage au Japon et a été identifié grâce à la surveillance génomique basée sur les voyageurs du CDC.

La plupart de ces patients ont présenté des symptômes légers, selon CNN.

Le problème est que la variante BA.2.86 présente plus de 30 changements génétiques par rapport à son ancêtre BA.2.

Cela rend son évolution similaire à celle qui s’est produite lorsque le virus a muté du variant Delta à l’Omicron hautement contagieux en 2021, selon CNN.

Cela est également comparable à la divergence entre BA.2 et XBB.1.5 survenue un an plus tard, a déclaré le CDC.

« Je pense, et je pense que tout le monde est d’accord, que cela est très probablement un mutant d’échappement des anticorps de neutralisation, ce qui signifie qu’il sera plus difficile pour notre organisme de nous protéger contre une infection par cette variante », a déclaré Bette Korber, biologiste computationnelle au Los Alamos National Labs au Nouveau-Mexique, selon CNN.

Il n’est pas encore possible de savoir comment l’immunité se maintiendra, mais cela devrait devenir plus clair dans les prochaines semaines.

Korber travaille à clarifier la structure de cette variante, afin que d’autres scientifiques puissent en construire des modèles dans leurs laboratoires, selon CNN.

Il n’est pas non plus clair comment cette variante rivalisera avec les autres pour la domination.

« C’est encore le début. Elle n’a été découverte que la semaine dernière. Il se peut donc qu’elle ne se propage pas beaucoup car elle n’est pas compétitive pour d’autres raisons », a déclaré Korber.

Michael Diamond, qui étudie les virus à ARN émergents dans le monde entier à la Washington University School of Medicine de St. Louis, a déclaré que c’était pour l’instant une question d’attente.

« Bien que nous sachions qu’elle circule depuis plusieurs semaines (sur la base de l’analyse des lignées et des légères différences de séquence), nous ne savons pas encore si elle émergera et deviendra dominante », a écrit Diamond dans un courriel à CNN.

Les premiers échantillons connus de BA.2.86 ont été prélevés fin juillet, selon CNN.

Les scientifiques soupçonnent qu’elle a pu se propager dans une région qui n’envoie pas de séquences à la base de données en libre accès GISAID, où les informations génétiques sur le virus sont partagées.

C’est différent de la propagation de l’Omicron, où les scientifiques ont pu suivre sa croissance rapide. Pour cette variante, personne n’a observé sa propagation locale.

« Les échantillons viraux ne sont pas encore largement disponibles pour des tests de laboratoire plus fiables des anticorps, et il est trop tôt pour connaître les impacts réels sur l’immunité », indique le rapport du CDC.

Plus d’informations

L’Organisation mondiale de la santé propose plus d’informations sur le suivi des variants de la COVID-19.

SOURCES : Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis, 23 août 2023 ; CNN, 23 août 2023